本局表示，扣繳義務人自動將應扣未扣或短扣之稅款，向稽徵機關補繳所漏稅款，依稅捐稽徵法第48條之1規定，在未經檢舉、未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查之案件，適用自動補繳只加徵利息之規定，可免受未依規定扣繳之處罰。
　　
本局呼籲扣繳義務人，應於每月10日前將上一月內所扣稅款向國庫繳清。另99年度各類所得扣繳暨免扣繳憑單應依所得稅法第92條規定期限，於100年1月底前申報，如逾限始自動補報，仍應依同法第114條第2款規定處罰，請扣繳義務人依規定期限申報，以免受罰。