本局表示，行政處分於法定救濟期間經過後，而發生形式確定力者，基於法之安定性原則，相對人或利害關係人應尊重其效力，原不得再對之爭訟。惟為保護相對人或利害關係人之權益及確保行政處分之合法性，於法定救濟期間經過後，而當其具有法定事由時，為符合法治原則，乃准許行政處分之相對人或利害關係人得向行政機關申請撤銷、廢止或變更行政處分。故行政程序法第128條規定即賦予行政處分之相對人或利害關人，在一定條件下，得向行政機關申請重新進行行政程序，而行政機關基於其申請，乃就已確定之行政處分所規定之事項，重為實質之審查，以作成適當之新決定。

本局進一步說明，行政程序之重新進行，應具備行政程序法第 128條第 1項之要件，並應於同條第 2 項規定之期間內申請，始得為之。若已逾申請期間，其申請即非合法。但要特別說明的是，若納稅義務人之爭議事項業經行政法院實體判決後，依法務部91年8月12日法律字第0910029335號函釋，若經行政法院實體確定判決予以維持之行政處分，關係人可依再審程序謀求救濟，故不在重新進行行政程序之列。納稅義務人得依再審程序謀求救濟者，自無行政程序法第128條規定之適用。

另經實體判決予以維持之行政處分，納稅義務人若曾提起再審程序並經駁回者，復依法務部97年6月16日法律字第0970016884號函釋，關於行政處分經行政法院實體判決確定且經再審裁定駁回，既已踐行通常之救濟途逕，即與行政程序法第128條得申請重新進行行政程序之規定不符，則無依據該條規定予以准許重新進行之適用。

本局重申，行政程序法第128條規定之適用客體須係已不可爭訟之行政處分，倘行政處分之相對人或利害關係人已依法提起訴願或行政訴訟，即發生阻斷原行政處分確定之效果，自應循該救濟程序救濟（包括再審程序），並無適用行政程序法第128條規定申請撤銷、廢止或變更原行政處分之餘地。