本局表示，納稅義務人接到補稅繳款書及核定通知書後，如發現有記載、計算錯誤或重複時，應於規定之繳納期間內，向國稅局申請更正；如納稅義務人對於因適用法令錯誤或計算錯誤溢繳之稅款，得自繳納之日起5年內提出具體證明，申請退還；對於核定內容、或適用法令認有違誤或不當時，應依規定格式，敍明理由，連同證明文件，於核定通知書送達30日內或補稅之繳納期間屆滿翌日起算30日內向國稅局申請復查。

　 本局指出，依稅捐稽徵法第17條規定，限於繳納通知文書有記載、計算錯誤或重複，始能申請更正。至於申請退還溢繳稅款，則限於適用法令錯誤或計算錯誤，依稅捐稽徵法第28條規定，自繳納之日起5年內提出具體證明，申請退還。如係對核定內容或法令依據有異議時，則應依稅捐稽徵法第35條第1項規定，依規定格式，敍明理由，連同證明文件，有應納稅額或應補稅額者，在規定之繳納期間屆滿翌日起算30日內；無應納稅額或應補稅額者，在核定通知書送達後30日內，向國稅局申請復查。

本局呼籲，納稅義務人接到補稅繳款書與核定通知書，如有疑義時，應儘速向國稅局查詢，以保障自身之權益，並減少徵納雙方之爭議。