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公司申請企業營運總部租稅獎勵，應依相關規定辦理
財政部臺北市國稅局表示，為鼓勵公司運用全球資源，進行國際營運佈局，在中華民國境內設立達一定規模且具重大經濟效益之營運總部，其投資國外關係企業取得之投資收益及處分利益，免徵營利事業所得稅，惟應注意其相關成本費用，應自該投資收益項下減除。
該局說明，企業在臺設立營運總部，適用「促進產業升級條例」各項稅捐優惠，應符合行政院訂頒「企業營運總部租稅獎勵實施辦法」，以及授權財政部賦稅署及經濟部工業局訂定「營運總部租稅獎勵表」、「企業營運總部營運範圍認定要點」之規定。依上揭法令規定，在臺設立營運總部之公司投資國外關係企業取得之投資收益，免徵營利事業所得稅，惟須將相關成本費用以直接歸屬或比例分攤方式，自取得之投資收益項下減除後，享受免徵營利事業所得稅。
該局指出，甲公司係在臺設立營運總部之企業，查核該公司93年度營利事業所得稅結算申報案時，發現該公司列報取得國外關係企業分配之投資收益，適用免徵營利事業所得稅，惟未將應直接歸屬及無法直接歸屬按合理比例分攤之營業費用減除，核與上揭規定不符，遂依規定將應歸屬該投資收益負擔之營業費用自投資收益項下減除，核定補稅8百餘萬元。
該局呼籲公司申請適用企業營運總部租稅獎勵時，應確實依稅法相關規定辦理，以維自身權益。
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